第一階段諾亞公園

游戲的初始關卡，必須強制通過。而本關之后第二階段的8個關卡順序則可自由選擇。
關卡要點：當過第一個小水溝時，要注意艾克斯無法蹲下，也無法斜向下射擊那些小蟹形機器人。然后遇到的一處懸崖需要艾克斯沖刺才能過去，第一次玩會讓你大呼頭痛。對于杰洛的考驗是，第一次要進行2段跳才能飛到房間上方出口，熟悉操控是本關的最大任務。

隱藏要素
1.杰洛在遇到的第一個瀑布前進行2段跳，跳進瀑布里的一個平臺，可得到稀有金屬。
2.前提是艾克斯已取得了頭部配件，從第一個房間出來后，跳起就可看到畫面頂部出現了一些金屬，旁邊有一處地方巖石與眾不同，艾克斯在下面跳起擊破巖石，上去后取得稀有金屬。
3.主角必須是艾克斯，時機是第二次進入諾亞公園，地點在前次需要杰洛第一次進行2段跳的房間前，可發現先前沒有打開的門這次開啟了，艾克斯進入后得到手腕配件I。
獎勵關卡：在瀑布前鎮壓小蟹形機器人的暴亂，敵人數量很多，但威脅不大，唯一需要注意的是那只飛來飛去的機械手。本關最大可殺敵999，目的就是賺取金屬，沒有實際意義。
Boss：鐵手機器人
Boss戰技巧：本關會3次遇見Boss鐵手機器人，他會一次比一次表現強。第一次露面，建議選擇艾克賽爾滯空射擊它，一旦被它的飛爪擒住，趕緊換人就OK了。第二次要待它從瀑布中露頭了才能打擊它，不過可使用雙重攻擊。最后一次，這廝變得很強了，需要艾克斯蓄力后射擊其頭部使它暫時癱瘓，然后再攻擊其背部，并注意收集它掉落的鉆石。幾次發動雙重攻擊之后就可擊敗它了。