在幕府將軍2的原版中宗教對于玩家也有很大的影響，而在武士之殤這個功能將被效忠對象取代。至于不同效忠對象的影響，且看我們細細分析，希望玩家你能夠滿意。

將軍2中神道教和基督教的對立在武士之殤中將由效忠於天皇或將軍的方式取代。不同於宗教只對國家有輕微影響，政治效忠是每一個氏族要重視的，你的新撰組角色(或是維新志士)會在所在地「傳教」。(招募這些事務官的建筑能提升稅收)如同將軍2中基督教和一向宗的傳播，政治思想傳播能造成民眾不滿及提升鼓動起義的機會。由於這不歸類於敵意行為，這是一個很賊的方法去不戰而削弱附近的氏族，記著先下手為強，同時確保你的新領地政治思想免得打仗時后園起火。